Yeşilova’nın  MÖ. 5700 de terk edilmesinden yaklaşık 300 yıl sonra, Bornova Ovası’na yeni toplulukların gelmeye başladığı ve  Yeşilova Höyüğü’nün 500 metre kuzeybatısındaki Yassıtepe Höyüğü’ne   yerleşildiği  anlaşılmıştır. 

Günümüzden 5 bin yıl önce  Tunç Çağı’nda, yerleşimciler   Yassıtepe Höyüğü’nün  bulunduğu alanda bronzu kullanan,  savunma duvarlarıyla dış saldırılara karşı korunaklı uzun evlerden oluşan Troya kültürü kadar zengin İzmir’in  ilk kent yerleşimini kurulmuştur. Yassıtepe Höyüğü İzmir kentinin 5 bin yıl önce ticari hayatının başladığı alanlardan biridir. İç Batı Anadolu’dan gelen malların denize ulaştığı yakın döneme kadar kervan yolları ile Manisa ve Kemalpaşa’ya ulaşılan aynı zamanda denizden Ege kültürleri ile bağlantıyı sağlayan yerleşim alanıdır.  Yüzlerce çanak çömleğe, mühüre,  tunç balta , iğne gibi eşyalara sahip bu  yerleşim,  MÖ.2800 civarındaki bir deprem ile yıkılana dek Erken Tunç Çağı’nda  üst üste 8 kez yıkılıp yeniden inşa edilmiştir. Heradot’un da dediği gibi “Symrna’nın gül ve bal kokulu Moskhatos (misket)” üzümünün de yetiştiği topraklara  ,üzüm ve  incir  kalıntılarına sahip Yassıtepe Höyüğü’nde  yerleşim,  Roma dönemine kadar kesintilerle devam etmiştir. Kazı çalışmaları 2010 yılından bu yana devam etmektedir. 

Her iki yerleşimde de çalışmalar Kültür ve Turizm Bakanlığı ve Ege Üniversitesi adına Doç.Dr.Zafer DERİN başkanlığında sürdürülmektedir. Kontrollü olarak turizme açık olan alanlardaki çalışmalar Kültür ve Turizm Bakanlığı, İzmir Büyükşehir Belediyesi ve Bornova Belediyesi’nin desteğiyle gerçekleştirilmektedir.