1922 yılı büyük yangınından önce, Frenk Caddesi’nin Mahmudiye (Yaladika) adını taşıyan bölümünde bulunan Aya Fotini; 1658 yılında deniz kıyısında inşa edilmiş,1688 depreminde yıkıldıktan sonra 1690'da yeniden yapılmıştır. Aya Fotini aynı zamanda metropolitik merkezi olmuştur.
Zamanla kıyının doldurulması sonucu içeride kalan kilisenin Hazreti İsa’nın ölüm yaşıyla bağlantılı olarak 33 metre yüksekliğinde olan çan kulesi 1856'da dikilir. İzmir’in en yüksek binası olması nedeniyle üzerindeki çan kulesine 1892 de büyük bir saat eklenmiştir. 1922 yılında yaşanan büyük yangında tamamen yanarak harabeye dönmüş ve yıkılmıştır.
Günümüzde Alsancak 1374 Sk. No:24'de yer alan Ortodoks kilisesinin (eski Felemenk Protestan Kilisesi) aynı adı taşıması dışında bu yapıyla bir bağı yoktur.